晋城市疾病预防控制中心的前身是晋东南地区卫生防疫站，始建于1953年，距今已有60多年的历史。1985年撤地建市变革为晋城市防疫站，1993年从长治南迁晋城办公。根据国家卫生体制改革精神，于2003年11月组建了晋城市疾病预防控制中心，是市政府实施疾病预防控制与公共卫生技术服务的正处级事业单位。主要担负着我市疾病预防控制、突发公共卫生事件应急处理，疫情及健康相关因素信息管理，健康危害因素监测与控制，实验室检测与评价，健康教育与健康促进，技术指导与应用研究等职能。